انضم معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان لدائرة الطيران المدني في أبو ظبي عام 1984 كوكيلاً في الدائرة ومن ثم تم تعيين معاليه كرئيساً للدائرة في عام 1991
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان رئاسة اللجنة العليا لأمن الموانئ والمطارات المدنية بالدولة منذ عام 2008
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان رئاسة المجلس الوطني للإعلام منذ عام 2010
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان حقيبة وزارة التعليم العالي والبحث العلمي منذ عام 2013
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان رئاسة جامعة الإمارات العربية المتحدة منذ عام 2013
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان حقيبة وزارة الأشغال العامة منذ عام 2004 لغاية آذار 2013
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان رئاسة مجلس إدارة برنامج الشيخ زايد للإسكان منذ عام 2004 لغاية آذار 2013
تولى معالي الشيخ حمدان بن مبارك آل نهيان رئاسة مجلس إدارة الهيئة الوطنية للمواصلات منذ عام 2006 لغاية آذار 2013